什么是普通的基因測序，它和高通量測序有什么區別嗎

404744321 2017-09-27 04:51:33 397 瀏覽

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三亞悅來旅館 2017-09-27 15:21:24

　　“普通的基因測序”應該是指“常規DNA測序”吧，是用Sanger法（也就是雙脫氧法）進行測序的方法，目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序，基本上可以做到600bp-800bp的讀長。　　高通量測序的概念其實是一個相對的概念，在2000年的時候，3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序，是相對手工測序或者跑平板膠來說的。　　不過到2005年以后，高通量測序就改指第二代測序（Next generation sequencing），454、Solexa(后改為Illumina）和SOLiD等第二代測序，比3730等diyi代測序的通量提高了成千上萬倍，甚至上億倍，所以稱為高通量測序。　　NGS的特點主要有：　　1、通量高。一個RUN能產生500Mb-600Gb的數據量。　　2、讀長相對較短。454(約400-500bp)，llumina（100-250bp），SOLiD（75-100）。　　3、單位數據的成本非常低。現在很多項目測序的費用。已經非常低。生物信息分析成本變得更為重要了。

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深度測序和普通的二代測序有什么區別？有什么應用

有兩種體細胞突變容易被忽視bai，一種是局限在特定組織的突變。舉例來說，如果突變只存在于大腦，而我們檢測的是血液，那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細胞突變雖然發生在所有組織中，但是只影響一部分細胞，因此不容易被檢測到。

　　普通的二代測序，全基因組或外顯子組測序是將DNA分成小片段，然后對各個片段多次讀取（一般是三十次）。然而，如果突變只發生在15-20%的細胞中，三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們，尤其是當突變只影響一個基因拷貝時。

　　Walsh和博士后Saumya Jamuar通過“定向高覆蓋度測序”技術，為158名腦部疾病的患者鑒定致病突變，這些患者的癥狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。

　　研究人員并沒有分析整個基因組或外顯子組（所有蛋白編碼基因），而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上，并且大大提高了測序的深度。

　　在一些疾病如唐氏綜合征中，嵌合突變相較于影響全身細胞的突變，產生的癥狀要輕一些。但是很少量的變異細胞就足以引發損害人身心健康的癥狀，在以往的研究中，為了從普通基因組中檢測到這些突變，研究人員就不得不增加測定的序列數量。而對少數候選基因區域進行的平均300次深度測序，就可以有效辨別被誤認為測序錯誤的突變。

2020-10-23 15:49:28 554 0