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Hieff NGS<sup>?</sup> Ultima? DNA Ligation Module 快速DNA連接模塊

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詳細(xì)介紹

Hieff NGS® Ultima DNA Ligation Module是針對(duì)Illumina®MGI®高通量測(cè)序平臺(tái)文庫構(gòu)建專業(yè)設(shè)計(jì)的DNA連接模塊,其中最大的亮點(diǎn)為本產(chǎn)品采用一款我公司自主研發(fā)的高效連接酶Fast T4 DNA ligase。本產(chǎn)品可在雙鏈平末端DNA片段或雙鏈3´-dA DNA片段的兩端連接Illumina®MGI®測(cè)序平臺(tái)適用的DNA接頭,具有連接效率高、簡便、可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化等優(yōu)勢(shì)。

本產(chǎn)品已與Hieff NGS® Ultima Endperp Mix(Cat#12605),2×Super Canace® II High-Fidelity Mix for Library Amplification(Cat#12621)共同用于DNA文庫構(gòu)建,通過Illumina®高通量平臺(tái)測(cè)序驗(yàn)證其有效性。

本產(chǎn)品已與Hieff NGS® Ultima Endprep Mix(Cat#12605)、2×Ultima HF Amplification Mix for MGI®Cat#13344)共同用于DNA文庫構(gòu)建,通過MGI®高通量平臺(tái)測(cè)序驗(yàn)證其有效性。

本產(chǎn)品中提供的所有試劑組分,都經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量與功能驗(yàn)證,最高程度保障產(chǎn)品優(yōu)異性能與批間穩(wěn)定性。


產(chǎn)品組分

產(chǎn)品編號(hào)

組分名稱

產(chǎn)品編號(hào)/規(guī)格

12604ES24

12604ES96

12604ES98

12604-A

Fast T4 DNA Ligase

120 μL

480 μL

4.8 mL

12604-B

5×Fast Ligation Buffer

480 μL

2 × 960 μL

2 × 9.6 mL

 

運(yùn)輸與保存方法

冰袋運(yùn)輸。-20℃保存,效期一年。


注意事項(xiàng)

1)為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
2)本產(chǎn)品僅作科研用途!


使用方法
1. Adapter的質(zhì)量和使用濃度直接影響連接效率及文庫產(chǎn)量。Adapter用量過高可能會(huì)產(chǎn)生較多Adapter Dimer;用量較低可能會(huì)影響連接效率及文庫產(chǎn)量。表1列舉了使用本試劑盒,不同Input DNA量推薦的Adapter使用量。

表1 . 500 pg-1 μg Input DNA推薦的Adapter使用濃度

Input DNA

Adapter : Input DNA摩爾比

Input DNA

Adapter : Input DNA摩爾比

1 μg

10:1

50 ng

100:1

500 ng

20:1

25 ng

200:1

250 ng

40:1

1 ng

200:1

100 ng

100:1

500 pg

400:1

【注】:Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)]。


2. 目前主流的合并法DNA建庫試劑盒,其末端修復(fù)和加A處理后一般不純化,直接進(jìn)行接頭連接。本試劑盒可與主流的商業(yè)化末端修復(fù)加A體系兼容,進(jìn)行接頭連接。反應(yīng)體系請(qǐng)參考如下配制,渦旋瞬離后置于20℃,反應(yīng)15分鐘即可。

表2 . Adapter Ligation體系

名稱

體積(μL)

dA-tailed DNA

60

5×Fast Ligation Buffer

20*

Fast T4 DNA Ligase

5

DNA Adapter

X**

ddH2O

To 100

【注】:*對(duì)于5×Fast Ligation Buffer,請(qǐng)上下顛倒、振蕩,充分混勻并瞬時(shí)后離心使用。

**根據(jù)自身需求加入適量的接頭。

【接頭添加計(jì)算舉例】當(dāng)Input DNA為100 ng,Input DNA長度為300 bp時(shí),接頭應(yīng)該添加多少?

第一步,計(jì)算Input DNA摩爾數(shù)。公式:Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)];

Input DNA 摩爾數(shù)(pmol)=100÷(0.66×300)=0.5 pmol;

第二步,計(jì)算接頭添加摩爾數(shù)。根據(jù)注意事項(xiàng)三表2查詢接頭添加比例

根據(jù)表2,查得Input DNA 100ng時(shí)接頭添加比例100:1,則接頭添加摩爾數(shù)=100×0.5 pmol=50 pmol;

第三步,計(jì)算接頭添加體積。接頭濃度=15 μmol/L(如使用其他接頭,濃度需要依據(jù)其他接頭濃度參數(shù));

接頭添加體積=接頭添加摩爾數(shù)(50 pmol)÷接頭濃度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL)

綜上,接頭可添加3.4 μL,加1.6 μL水補(bǔ)齊至5 μL。(注:接頭最大加入體積不超過5 μL)

 

HB210810

 

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